医院是知识和技术密集型单位，作为知识分子聚集的组织，把握好绩效考核的原则对整个医院的人力资源管理具有相当重要的作用。
一般而言，医院的绩效考核应坚持以下原则：
（1）客观、公正、公开的原则
在实施绩效考核时，一定要注意考核标准要客观，组织评价要客观，考核结果与待遇挂钩要客观。同时要公开各个岗位和各项工作的考核标准，在实施考核中对所有的员工做到一视同仁。
（2）科学评价原则
指从考核标准的确定到考核结果的运用过程设计要符合客观规律，正确运用现代化科技手段，准确地评价各级各类员工的行为表现。
（3）简便、易操作原则
考核标准简便、易操作一是有利于员工明确标准，确定努力方向；二是便于管理人员实施考核；三是可以较少的精力投入，达到比较好的考核效果。
（4）注重绩效的原则
绩效是指员工经过主观努力，为社会做出并得到承认的劳动成果，完成工作的数量、质量与效益等。在实施考核中，只有以绩效为导向，才能引导员工把工作的重点放在提高工作质量和效率，努力创造良好的社会效益和经济效益上来，从而保证医院目标的实现。
医院绩效考核的意义
现代医院进行科学的绩效考核具有如下的重要意义：
为医院各类员工的晋升、降职、调职以及聘任与解聘提供依据；对员工的工作质量、数量、效率、效益等进行科学的评估，为薪酬决策提供依据；医院通过对员工绩效考核的反馈，加强医院与员工之间的沟通，以增强组织的凝聚力和向心力；可以对医院的员工招聘，工作分配的效果以及团队精神等进行评估；对医院人力资源的政策导向，培训与教育以及员工的职业生涯规划效果进行评估等。
“以服务为导向，以病人为中心”的分配导向
在新医改背景下，随着医疗市场竞争的日益激烈，临床医生等医疗人才已成为医院提高核心竞争力的重要关键因素，其价值受到广泛关注。
医院沿袭多年的以收支结余为主线的分配模式导致了医院内部分配不均衡、无法体现按劳分配的原则、部分学科发展受限制等问题。
过去医院实行内部绩效考核制度和综合管理体制的基本内容与核心是，采用收支结余和与经济收益挂钩的模式，这样的导向实质鼓励临床科主任拼命追求经济效益，这对于当时落后的计划经济模式是进步的，但由于一切向利益看齐，医院是发展了，但风气败坏了，纠正这种趋势采用更好的方法来进行绩效考核，如何建立一个规范、统一、公平、合理的考核体系，以衡量员工的绩效、以及作为岗位设置和薪酬分配的基础。
“多劳多得、优绩优酬”的绩效考核与分配方案
收支结余不能真正反映出科室的工作量、工作强度和技术难度，不能反映出服务质量与病人的满意度，绩效考核既要体现出工作量，更要体现出医疗质量。
合理的考核制度应限制以经济利益为目的的管理行为，以科室和个人产生的劳动价值对医院和社会的贡献来进行考核，这些贡献不是经济效益，不单纯追求“量”，而是追求“质”，不是“多收多得”，而是“优劳优得”
，这需要通过很多核心要素的指标来实现。 考虑到医院目前处于快速发展期，主要强调医疗工作保质保量，将医疗服务尽可能多地涵盖百姓群众，努力缓解百姓看病贵、看病难现象，故针对临床医生采取院科两级分配的模式，同时采用“基本薪酬+（服务量+疑难风险）×（医疗质量+医疗安全+满意度+医德医风+医药费用控制+工作考勤）”
的绩效分配模式，促进服务量和医疗质量同步增长与发展。 如何建立一个规范统一、公平合理的考核体系？绩效怎么应用？要与将来的事业发展，如医院、学科、科室挂钩；与聘任，如学科带头人、科主任的聘用挂钩。绩效低和高决定了个人在医院的前程、在行业的前程，只有这样才会对绩效高度关注。
如何建立一个规范、统一、公平、合理的考核体系，以衡量员工的绩效、以及作为岗位设置和薪酬分配的基础？
现在医院存在一些不合理现象，有些科室相对来说赚钱比较容易，分配就高，有些科室辛劳程度一点不亚于其他科室，但不能赚很多钱，反而分配较低，就像把种子撒在肥沃的土地能长出很多粮食，而土地贫瘠，再怎样耕耘怎么用心收成总是低的，所以要处理好不同学科不同专业之间的差异性，绩效分配不能根据科室收支结余的多寡而定。
实行绩效考核与分配以服务质量和岗位工作量为主的综合绩效考核和岗位考核制，具体分为临床科室负责人和临床科室医生两类人群分别进行绩效考核与分配。
临床科室负责人的绩效考核与分配主要是由医院根据其所管理的临床科室所承担的医疗服务涵盖范围，并综合考虑其在科室管理、业务发展、预算执行、人才培养、科研教学等方面的表现，制定阶段性固定的上浮系数，再依据其所负责管理的临床科室包含的在职医生绩效考核后的平均绩效奖金数据，两者的乘积形成了临床科室负责人的绩效考核与分配数值。
如何体现公平性、合理性与竞争性的关系？如果一味追求公平，会对学科与学科之间、同一科室医务人员之间合理竞争产生负面影响，所以既要体现公平又要体现合理是重要的。
道恒认为考核的结果没有绝对的公平，但在考核的程序上能够把握公平，就能够达到相对的公平，因为公平，可以更有效地调动医务人员的工作积极性，而不是创收积极性。
