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目前，大多数中小医院存在着片面的一味追求经济效益，忽视科研的重要性，从而影响医院自身发展的严重问题。其具体表现在以下三个方面：
1.受医院自身经济基础和环境限制，没有一系列完善的科研仪器、设备和专门的实验室供临床医生开展各项科学研究；
2.由于中小医院自身规模有限，各科室人员配备在正常运转的前提下，仅能确保临床医疗工作任务的顺利展开与完成，导致临床医生工作繁忙，没有空余时间开展各项科学研究；
3.中小医院的科研管理者知识水平参差不齐，有的甚至直接由行政领导兼任，导致其在科研工作中只能从形式上申报或者管理项目，不能客观地了解项目的专业内容、进展情况和研究水平。这些都严重地限制了中小医院进一步发展、壮大的脚步和进程。
科研是医学科学发展的主动力。医院要在市场经济环境中持续发展，必须依靠科技进步和创新来提高医院的核心竞争力。医学科研管理则是对人、财、物等有限资源进行合理配置，最大限度地实现研究任务，为医院的科研发展和可持续性发展打下坚实基础。
医院科研需要良好有序的管理为基础，并确立灵活实用的政策法规，举办形式多样的科研促进活动。
一、召开科技大会，确定攻关项目，落实激励政策，营造科研氛围
医院适应改革创新新形势，转变管理新机制，针对医务人员科研意识淡漠、科研氛围不浓、科研起点过低等问题，每年召开技大会，倡导科技兴院、修订奖励办法，制定年度重大攻关课题。在会议精神的鼓舞下，可调动广大医院员工参与科研的积极性，保障了医院科技工作的可持续发展。
二、突出科研目标管理，促进医院科研水平跨越式发展
医院科研需要用远期目标统揽全局，远期目标的主要形式就是瞄准国际一流的研究型医院以及数字化现代医院。标准目标通常要求具体、明确和方便考核、落实。制定合理可行的科研发展规划，通过完成重点目标实现科研工作上的突破。
对近期目标进行细化、量化，并采用科主任任期目标责任制的形式，把目标细化到学科，落实到人，利用考评、考核把各项指标落实到实处，以保证远期目标的实现。
三、举行科研课题招标会，开展科研沙龙，加强协作交流
医院可以通过请进来、走出去的方式积极与国内外科技部门联系，争取项目、协同攻关，每年举行一次科技项目招标会，为临床科室提供课题。每年需要受理下一年度的课题，年初举行专题报告，由本院学术委员会我院外科专家组成评审组，采用多媒体形式汇报，通过课题的科学性、先进性、可行性，经综合评价后确定项目，对涉及多科室项目，成立跨科室联合科研小组，协作攻关。
因此，医院要改变这种局面，走出医院发展长期停滞不前的现状，必须审时度势，重新思考，加强对科研重要性的认识，针对医院自身存在的各种缺点和不足，提出切合实际的解决方案，从根本上走出困境。
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